Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms