Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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