Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms