Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms