Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms