Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms