Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms