Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL35Q6PF15 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms