Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms