Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms