Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms