Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms