Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms