Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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