Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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