Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ECM1Q16610 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ECM1Q16610 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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