Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms