Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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