Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNA2Q15822 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms