Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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