Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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KCNC3Q14003 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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KCNC3Q14003 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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KCNC3Q14003 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC3Q14003 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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