Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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