Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms