Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms