Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms