Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMX2Q04743 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms