Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms