Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms