Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms