Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K9P80192 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms