Protein–RNA interactions for Protein: P57081

WDR4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR4P57081 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR4P57081 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR4P57081 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR4P57081 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR4P57081 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR4P57081 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR4P57081 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR4P57081 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR4P57081 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR4P57081 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR4P57081 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR4P57081 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR4P57081 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR4P57081 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR4P57081 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR4P57081 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR4P57081 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR4P57081 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR4P57081 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR4P57081 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR4P57081 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR4P57081 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR4P57081 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR4P57081 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR4P57081 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR4P57081 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR4P57081 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR4P57081 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR4P57081 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR4P57081 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms