Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms