Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms