Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms