Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms