Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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HOXD13P35453 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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