Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKARP32238 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKARP32238 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKARP32238 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKARP32238 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKARP32238 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKARP32238 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKARP32238 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKARP32238 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms