Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB2P29033 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB2P29033 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB2P29033 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB2P29033 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB2P29033 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB2P29033 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB2P29033 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB2P29033 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB2P29033 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB2P29033 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB2P29033 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB2P29033 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB2P29033 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB2P29033 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB2P29033 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB2P29033 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB2P29033 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB2P29033 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB2P29033 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB2P29033 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB2P29033 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB2P29033 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB2P29033 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms