Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms