Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms