Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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