Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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