Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms