Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A1P19634 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms