Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPCAMP16422 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms