Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KALRNO60229 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KALRNO60229 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KALRNO60229 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms