Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms