Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLGNO14967 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms