Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms