Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PHLDA3Q9Y5J5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHLDA3Q9Y5J5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms